MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187101	GGA	2	6	9	14	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187101	TATT	2	8	15	22	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187101	A	6	6	3596	3601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187101	TTTTA	2	10	3642	3651	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187101	GAG	2	6	3696	3701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187101	GA	3	6	3844	3849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187101	GCG	2	6	4120	4125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187101	CA	3	6	5698	5703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NT_187101	A	6	6	5726	5731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187101	AAT	2	6	5737	5742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187101	CATA	2	8	5750	5757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NT_187101	AAT	2	6	5763	5768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187101	T	7	7	9111	9117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187101	ATT	2	6	9216	9221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187101	TTG	2	6	10333	10338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187101	AT	3	6	10375	10380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187101	ATT	2	6	10398	10403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187101	AAC	2	6	10405	10410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187101	A	7	7	10413	10419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187101	CGA	2	6	14403	14408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NT_187101	AGG	2	6	14447	14452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187101	ACC	2	6	15294	15299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NT_187101	TGA	2	6	15312	15317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187101	ATT	2	6	15318	15323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187101	TGT	2	6	15339	15344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187101	TTCA	2	8	15357	15364	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NT_187101	AGG	2	6	16031	16036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187101	TAT	2	6	16059	16064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187101	AAATA	2	10	16080	16089	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187101	TC	3	6	16841	16846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NT_187101	AAT	2	6	16851	16856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187101	AAC	2	6	16873	16878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187101	GTGA	2	8	16908	16915	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187101	CGA	2	6	16927	16932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187101	ATA	3	9	16981	16989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187101	ATT	2	6	17015	17020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187101	TAAT	2	8	17030	17037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187101	ATA	2	6	17069	17074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187101	GAA	2	6	17094	17099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187101	ATT	2	6	17126	17131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187101	TTTA	2	8	17175	17182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187101	ACCT	2	8	17188	17195	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NT_187101	GCAG	2	8	18058	18065	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NT_187101	G	6	6	18081	18086	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187101	ACC	2	6	18194	18199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NT_187101	ATA	2	6	18245	18250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187101	AAT	2	6	18293	18298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187101	TGGG	2	8	18352	18359	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187101	CAT	2	6	18372	18377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_187101	AGCG	2	8	18393	18400	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NT_187101	GCG	2	6	18466	18471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187101	GCCA	2	8	18505	18512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NT_187101	AGG	2	6	18589	18594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187101	ATC	2	6	18605	18610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187101	CATA	2	8	18737	18744	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NT_187101	ATC	2	6	18800	18805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187101	T	6	6	18859	18864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187101	CTAT	2	8	18885	18892	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NT_187101	ATT	2	6	18909	18914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187101	ACA	2	6	18932	18937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187101	TGT	2	6	18956	18961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187101	GAT	2	6	18994	18999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187101	AT	3	6	19023	19028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187101	GTT	2	6	19032	19037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187101	TAA	2	6	19075	19080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187101	TAA	2	6	19094	19099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187101	AACA	2	8	19127	19134	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NT_187101	TTC	2	6	19148	19153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NT_187101	GGT	2	6	19179	19184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187101	A	7	7	19292	19298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187101	ATT	2	6	19351	19356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187101	GCA	2	6	19750	19755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NT_187101	CAT	2	6	19763	19768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187101	TCC	2	6	21069	21074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NT_187101	TTA	2	6	21080	21085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187101	ATTA	2	8	21104	21111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187101	A	6	6	21318	21323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187101	ATC	2	6	21397	21402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_187101	TAT	2	6	21407	21412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187101	TAT	2	6	22475	22480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187101	TTAT	2	8	22498	22505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187101	GATT	2	8	22635	22642	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187101	TGA	3	9	22650	22658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187101	AAC	2	6	22695	22700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187101	ATT	2	6	22739	22744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187101	GATT	2	8	22751	22758	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187101	AAT	2	6	22769	22774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187101	A	6	6	22794	22799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187101	T	6	6	22822	22827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187101	CGG	2	6	22883	22888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NT_187101	ACC	2	6	22955	22960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NT_187101	TGA	2	6	22961	22966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187101	TA	3	6	22968	22973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187101	TGA	2	6	23146	23151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187101	TG	3	6	23189	23194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187101	C	6	6	23235	23240	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
97	NT_187101	AG	3	6	24839	24844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187101	CGG	2	6	26035	26040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NT_187101	GGC	2	6	26045	26050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NT_187101	GTT	2	6	27505	27510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187101	ATT	2	6	27537	27542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187101	TTTTA	2	10	27571	27580	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187101	TGA	2	6	27582	27587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187101	TTC	2	6	27692	27697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NT_187101	AAGG	2	8	29137	29144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187101	GAA	2	6	30672	30677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187101	TGC	2	6	30678	30683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NT_187101	CAA	2	6	30758	30763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NT_187101	ATT	2	6	30768	30773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187101	TGC	2	6	30818	30823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NT_187101	A	6	6	30826	30831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187101	TTA	2	6	30893	30898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187101	GCT	2	6	32606	32611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NT_187101	TCCT	2	8	32655	32662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NT_187101	ATG	3	9	33309	33317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187101	ATT	2	6	33321	33326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187101	CTA	2	6	33455	33460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NT_187101	TAT	2	6	34235	34240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187101	CCGG	2	8	34270	34277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NT_187101	GCAT	2	8	36734	36741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NT_187101	TG	3	6	37587	37592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187101	T	6	6	37603	37608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187101	CAA	2	6	37657	37662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NT_187101	TAAT	2	8	37694	37701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187101	ATTG	2	8	37706	37713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187101	TA	3	6	37723	37728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187101	TTTGA	2	10	37729	37738	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187101	AAG	2	6	37794	37799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187101	TGT	2	6	37843	37848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NT_187101	GCAT	2	8	39169	39176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NT_187101	C	9	9	39204	39212	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
132	NT_187101	G	7	7	39219	39225	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.